Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms