Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS9D1Q9Y2B5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms