Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms