Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms