Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms