Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RETNLBQ9BQ08 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms