Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIMKLAQ8IXN7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIMKLAQ8IXN7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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