Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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USP43Q70EL4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
USP43Q70EL4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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