Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC1Q08554 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms