Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms