Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms