Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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VAPBO95292 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAPBO95292 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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