Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS37CA5D8V6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms