Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms