Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNRF3Q9ULT6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms