Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms