Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms