Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP4Q9P0V3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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