Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms