Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms