Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PDZK1Q5T2W1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDZK1Q5T2W1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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