Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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