Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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