Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms