Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms