Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRDP23468 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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