Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CREB1P16220 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms