Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT10P13645 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms