Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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