Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms