Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms