Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCF2Q9UG63 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCF2Q9UG63 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms