Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms