Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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