Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms