Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms