Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTXN3Q4LDR2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms