Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms