Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CUL3Q13618 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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CUL3Q13618 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CUL3Q13618 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CUL3Q13618 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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