Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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PEX6Q13608 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PEX6Q13608 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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