Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HBBP68871 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HBBP68871 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms