Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms