Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP5P51878 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP5P51878 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP5P51878 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP5P51878 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms