Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
IFI27P40305 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFI27P40305 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms