Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms