Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GPC1P35052 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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