Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECHS1P30084 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms