Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLD1P28340 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms