Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTFP26441 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTFP26441 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms