Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms